Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms