Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND3Q5T5X7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms