Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms