Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms