Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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