Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms