Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALFQ53S48 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms