Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms