Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q499Y3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q499Y3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q499Y3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q499Y3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q499Y3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q499Y3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q499Y3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms