Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms