Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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