Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms