Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms