Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms