Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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