Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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GEN1Q17RS7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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GEN1Q17RS7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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