Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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