Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms