Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFE2Q16621 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms