Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms