Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms