Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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