Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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