Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms