Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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