Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms