Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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