Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITSN1Q15811 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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