Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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