Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms