Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARHGEF6Q15052 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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