Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCLAFQ15004 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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