Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME4Q14997 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms