Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSPNQ14714 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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