Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSC3Q14574 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms