Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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