Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFR3AQ14156 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms