Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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