Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms