Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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