Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms