Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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SEMA3BQ13214 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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