Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms