Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PTP4A2Q12974 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PTP4A2Q12974 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PTP4A2Q12974 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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PTP4A2Q12974 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTP4A2Q12974 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTP4A2Q12974 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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