Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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