Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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