Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC10A2Q12908 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms