Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMEM115Q12893 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM115Q12893 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM115Q12893 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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