Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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