Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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